More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2986 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
611 aa  1226    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  39.17 
 
 
590 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  37.31 
 
 
592 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  38.8 
 
 
596 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  35.33 
 
 
597 aa  335  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  35.23 
 
 
598 aa  326  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  36.5 
 
 
586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  34.55 
 
 
595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  34.22 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  34.49 
 
 
584 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  33.78 
 
 
619 aa  294  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  34.72 
 
 
585 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  35.2 
 
 
600 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  34.27 
 
 
598 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
586 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  32.05 
 
 
579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  33.22 
 
 
580 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.5 
 
 
543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 
619 aa  233  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.97 
 
 
545 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  32.16 
 
 
504 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 
539 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.56 
 
 
539 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.39 
 
 
539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.17 
 
 
539 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.74 
 
 
544 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.74 
 
 
539 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  28.91 
 
 
544 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.29 
 
 
539 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.24 
 
 
539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 
523 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  30.03 
 
 
524 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  29.7 
 
 
511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.61 
 
 
541 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.39 
 
 
556 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 
555 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  31.01 
 
 
543 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.44 
 
 
531 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  31.53 
 
 
564 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 
522 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  28.15 
 
 
554 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  27.94 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  29.73 
 
 
557 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
540 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  30.67 
 
 
559 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
536 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  28.64 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  28.54 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  28.14 
 
 
519 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  29.78 
 
 
578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  26.38 
 
 
624 aa  143  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  29.28 
 
 
543 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  28.05 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  30.5 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  29.22 
 
 
617 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  31.69 
 
 
479 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  28.5 
 
 
562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  26.5 
 
 
581 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.19 
 
 
505 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  30.42 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.22 
 
 
475 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.87 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  29.4 
 
 
494 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  31.47 
 
 
498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.56 
 
 
537 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.56 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.97 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.56 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  32.79 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
540 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  29.8 
 
 
461 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 
477 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  30.46 
 
 
968 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
569 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
489 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.18 
 
 
552 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
569 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  30.81 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  30.65 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
553 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.23 
 
 
529 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
553 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
553 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  31.66 
 
 
488 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
541 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
558 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  30.79 
 
 
474 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
545 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  31.06 
 
 
475 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  27.65 
 
 
504 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 
524 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
555 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 
477 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>