More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2238 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2238  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 398 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38483  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1906  glycosyl transferase, group 1  75 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  46.81 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  46.72 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  45.62 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  45.62 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  45.62 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  45.04 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  50 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  40.63 
 
 		 367 aa  216  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3525  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  33.92 
 
 		 371 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  33.92 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4444  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0794772  hitchhiker  0.000041841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  28.65 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.93 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  28.42 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  28.17 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  32.93 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.99 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.99 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  28.65 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  30.5 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  27.56 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  27.63 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3920  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  30.91 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  28.13 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 743 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 820 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  37.71 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.68 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  38.19 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  29.09 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  31.1 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.11 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  42.03 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  28.78 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24.8 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>