More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0946 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4242  ABC transporter related  59.9 
 
 		 644 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.235556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0946  ABC transporter related  100 
 
 		 639 aa  1284    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.039967  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  32.8 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  33.07 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  32.91 
 
 		 594 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.36 
 
 		 595 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  31.38 
 
 		 613 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3695  ABC transporter related  35.93 
 
 		 603 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  32.97 
 
 		 618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  33.65 
 
 		 607 aa  260  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  36.88 
 
 		 621 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  36.52 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  34.35 
 
 		 591 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  33.86 
 
 		 618 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  33.53 
 
 		 706 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  51.23 
 
 		 598 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  35.85 
 
 		 622 aa  253  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  50.82 
 
 		 598 aa  253  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.18 
 
 		 617 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.91 
 
 		 619 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  32.79 
 
 		 593 aa  251  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  31.48 
 
 		 587 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  34.73 
 
 		 616 aa  252  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  29.03 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  34.2 
 
 		 597 aa  251  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  37.74 
 
 		 621 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  35.09 
 
 		 619 aa  249  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  33.53 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  38.04 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  37.41 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  33.4 
 
 		 613 aa  248  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  33.08 
 
 		 636 aa  247  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  40.6 
 
 		 582 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 		 609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  32.1 
 
 		 610 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.67 
 
 		 580 aa  246  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 		 630 aa  246  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  36.35 
 
 		 615 aa  246  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  34.49 
 
 		 611 aa  246  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  33.72 
 
 		 618 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  35.85 
 
 		 619 aa  246  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.87 
 
 		 619 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3208  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.77 
 
 		 625 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.39 
 
 		 608 aa  245  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 616 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  31.95 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 		 609 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 		 632 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.55 
 
 		 598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  32.12 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  52.67 
 
 		 603 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.61 
 
 		 612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  32.37 
 
 		 609 aa  244  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  36.3 
 
 		 617 aa  244  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  32.2 
 
 		 610 aa  244  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.02 
 
 		 617 aa  243  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  36.76 
 
 		 617 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  32.31 
 
 		 609 aa  243  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  32.88 
 
 		 609 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  33.52 
 
 		 622 aa  243  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  32.95 
 
 		 609 aa  243  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  32.69 
 
 		 609 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.91 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.69 
 
 		 609 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.77 
 
 		 594 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  31.76 
 
 		 603 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  32.69 
 
 		 609 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  35.32 
 
 		 614 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  36.17 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  34.07 
 
 		 658 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  36.99 
 
 		 617 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  33.96 
 
 		 617 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  34.67 
 
 		 614 aa  240  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  36.67 
 
 		 617 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  36.67 
 
 		 617 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  33.75 
 
 		 617 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  31.54 
 
 		 609 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  33.44 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  35.35 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  35.12 
 
 		 612 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  32.18 
 
 		 609 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  33.52 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0083  eflux ABC transporter inner membrane protein  32.39 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  30.58 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  36.59 
 
 		 646 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2642  ABC transporter related  34.23 
 
 		 614 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.988853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  36.59 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  29.37 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  34.61 
 
 		 613 aa  238  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  33.9 
 
 		 603 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  32.82 
 
 		 626 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  32.12 
 
 		 609 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.06 
 
 		 614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.71 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  34.39 
 
 		 637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.52 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  36.19 
 
 		 626 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  31.96 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0090  ABC transporter related  51.91 
 
 		 636 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>