More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3011 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3011  adenylate kinase  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  76.53 
 
 		 199 aa  296  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  49.48 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  47.62 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  47.85 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  48.39 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  46.63 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  47.8 
 
 		 187 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  46.96 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  46.07 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  48.9 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  48.35 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  39.91 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  43.9 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  47.4 
 
 		 360 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  48.92 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  43.98 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  43.75 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  45.92 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  43.75 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  48.62 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  46.23 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  47.87 
 
 		 367 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  44.04 
 
 		 193 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.81 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  43.23 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  43.06 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  46.35 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  46.24 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  43.9 
 
 		 423 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  46.88 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  45.95 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  45.16 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  44.79 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  44.95 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  47.51 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  44.62 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.91 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.91 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  37.96 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  41.01 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  41.86 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  42.58 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  45.83 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  44.86 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  44.85 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  47.31 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  47.31 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  44.51 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  46.24 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  47.31 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  44.79 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  40.65 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.71 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  40.65 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  44.15 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  42.11 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  40.19 
 
 		 213 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  46.96 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  48.07 
 
 		 181 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.46 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  40.87 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  39.45 
 
 		 217 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  42.55 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  45.83 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  46.2 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  45.31 
 
 		 341 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  37.56 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  41.83 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  41.15 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  40.65 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  39.72 
 
 		 216 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  38.76 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  40.44 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  40.38 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  44.32 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  45.86 
 
 		 182 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  38.89 
 
 		 217 aa  147  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  41.33 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  40.74 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  42.72 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  41.35 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  40.66 
 
 		 194 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  46.77 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  41.98 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  39.53 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  41.08 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  45.86 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  40 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  43.01 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  39.91 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  39.25 
 
 		 367 aa  145  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  41.83 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  38.6 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  43.75 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  43.75 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  42.7 
 
 		 183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  38.71 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  47.4 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>