284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2489 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2489  cytochrome b/b6-like  100 
 
 		 535 aa  1061    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.613935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1812  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.41 
 
 		 546 aa  628  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666264  normal  0.116322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3105  cytochrome b/b6-like  59.85 
 
 		 527 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.041819  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3292  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56.96 
 
 		 536 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3343  Cytochrome b/b6 domain protein  55.36 
 
 		 553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0961  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.23 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0908958  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1825  cytochrome b/b6 domain protein  56.02 
 
 		 522 aa  510  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3524  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.19 
 
 		 536 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1680  cytochrome b/b6 domain protein  50.7 
 
 		 543 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2674  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  52.63 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1376  cytochrome b/b6 domain protein  54.02 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3617  Cytochrome b/b6 domain protein  56.85 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2695  Cytochrome b/b6 domain protein  53.51 
 
 		 541 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.692335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3058  Cytochrome b/b6 domain protein  55.56 
 
 		 539 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12224  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrB (cytochrome B subunit)  56.89 
 
 		 549 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2953  cytochrome b/b6 domain-containing protein  56 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3251  Cytochrome b/b6 domain protein  50.2 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  decreased coverage  0.00000907942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3060  Cytochrome b/b6 domain protein  49.61 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3560  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.56 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723274  normal  0.0825671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4117  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.67 
 
 		 532 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.358172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10700  cytochrome b subunit of the bc complex  54.07 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.797183  normal  0.372195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8374  Cytochrome b subunit of the bc complex-like protein  52.98 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3253  Cytochrome b/b6 domain  51.51 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.510531  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3294  cytochrome b/b6-like protein  55.9 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3305  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.9 
 
 		 558 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216309  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3356  cytochrome b/b6 domain-containing protein  55.9 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162526  normal  0.0239806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1889  Cytochrome b/b6 domain protein  51.13 
 
 		 580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.271737  hitchhiker  0.00145846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2011  Cytochrome b/b6 domain protein  51.8 
 
 		 575 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.802913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1949  Cytochrome b/b6 domain protein  49.41 
 
 		 556 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1293  cytochrome b/b6 domain-containing protein  53.07 
 
 		 542 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.327176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2212  cytochrome b/b6-like protein  48.51 
 
 		 561 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184227  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14160  cytochrome b subunit of the bc complex  45.13 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.409631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3137  cytochrome b/b6 domain-containing protein  51.91 
 
 		 582 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15680  cytochrome b subunit of the bc complex  48.41 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1019  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  50.29 
 
 		 548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.110557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2078  Cytochrome b/b6 domain protein  51.07 
 
 		 583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16210  cytochrome b subunit of the bc complex  48.02 
 
 		 581 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.762158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3132  Cytochrome b/b6 domain protein  46.65 
 
 		 551 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12150  cytochrome b subunit of the bc complex  45.92 
 
 		 564 aa  438  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1449  cytochrome b/b6 domain protein  50.32 
 
 		 547 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0373061  normal  0.0523763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0554  Cytochrome b/b6 domain protein  50.6 
 
 		 551 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  36.24 
 
 		 488 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2472  Cytochrome b/b6 domain protein  36.9 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  35.23 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0470  Cytochrome b/b6 domain protein  35.9 
 
 		 425 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.02 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0319  cytochrome b/b6-like protein  34.33 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0663276  decreased coverage  0.00372414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  32.46 
 
 		 268 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  35.23 
 
 		 269 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  34.2 
 
 		 267 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  39.31 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  31.65 
 
 		 218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  31.65 
 
 		 218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  32.11 
 
 		 218 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  31.25 
 
 		 215 aa  113  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  30.26 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  30.26 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  31.19 
 
 		 218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  31.19 
 
 		 218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  31.65 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  30.26 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.11 
 
 		 215 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  32.11 
 
 		 215 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  31.14 
 
 		 222 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  30.73 
 
 		 218 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  35.45 
 
 		 247 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  31.19 
 
 		 222 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  31.19 
 
 		 222 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  26.18 
 
 		 224 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  26.18 
 
 		 224 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  29.02 
 
 		 222 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  25.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  27.43 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  32.84 
 
 		 206 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  29.6 
 
 		 222 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  30 
 
 		 431 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.61 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  32.21 
 
 		 206 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  28.29 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  28.62 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  28.29 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  28.7 
 
 		 367 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  25.62 
 
 		 469 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.58 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  28.35 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  25.67 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0445  cytochrome b/b6 domain-containing protein  29.21 
 
 		 358 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  26.87 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.81 
 
 		 410 aa  94  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  28.52 
 
 		 431 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>