More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1965 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1965  cytochrome P450  100 
 
 		 400 aa  808    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4349  putative cytochrome P450  42.97 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0143  cytochrome P450  42.05 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3367  cytochrome P450-like protein  43.73 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  42.29 
 
 		 416 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  29.38 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  27.42 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  26.52 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  27.96 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  27.16 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  26.15 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  28.53 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  27.71 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  26.68 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  28.73 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  25 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  28.2 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  26.94 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  28.09 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  26.75 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  26.97 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  26.75 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  27.38 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  23.14 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  28.06 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  25.95 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.65 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  28.27 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  25.2 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  28.53 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  26.5 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  26.14 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  26.93 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  28.04 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  28.04 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  28.04 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  25.07 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  28.04 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  25.07 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  28.15 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  27.04 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  26.56 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  29.34 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  26.63 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  26.4 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  26.39 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  26.17 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  25.7 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  27.13 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  29.05 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  26.77 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  23.23 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  28.09 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  26.5 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  25.33 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7155  cytochrome P450 CYP124E1  26.69 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.486175  normal  0.0237063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  27.65 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  26.11 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  25.79 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  26.56 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  27.65 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  26.48 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  26.3 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  25.84 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  27.19 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  25.49 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  22.57 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  25.77 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  25.49 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  25.77 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  27.46 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  25.49 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2020  cytochrome P450  26.67 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  25.77 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  27.65 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  26.81 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  25.93 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  24.56 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  23.72 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  26.37 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  26.34 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  27.88 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  22.79 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  26.83 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  26.83 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  27.25 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  26.89 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4317  cytochrome P450  25.45 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  24.15 
 
 		 938 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  25.72 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  26.67 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  26.98 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  26.84 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  26.2 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  26.2 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  25.07 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  26.76 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  27.64 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  24.92 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  25.79 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>