123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1748 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 		 159 aa  313  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  59.38 
 
 		 160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.04 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  46.38 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  45.86 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  41.56 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  42.55 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  35.4 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  39.35 
 
 		 173 aa  84.7  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  35.33 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  39.83 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.59 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  39.64 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  32.82 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.64 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.12 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.9 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.62 
 
 		 344 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  33.33 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.4 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.15 
 
 		 421 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  27.7 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  30.87 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  34.29 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  32.46 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  36.21 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  33.59 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  27.16 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  29.32 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  31.82 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  29.17 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.82 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  30 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  31.62 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  37.08 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  29.73 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  36.36 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28.86 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  40.74 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.41 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.56 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.03 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  25.55 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.03 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.04 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.8 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  34.62 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.53 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  31.68 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.81 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.7 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.26 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.61 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.45 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.44 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  25.55 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  27.21 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  25.36 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  34.62 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.93 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  36.51 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  36.78 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  31.71 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  30.39 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.38 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  26.53 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  23.88 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.93 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  32.43 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.14 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  24.09 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  34.12 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.35 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  32.39 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.95 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  33.02 
 
 		 117 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  26.54 
 
 		 233 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.42 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  23.49 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  28.17 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.53 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  29.6 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.84 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.21 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.21 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.18 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  28.42 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  31.52 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.15 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.21 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.42 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  40 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.42 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>