154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2487 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  100 
 
 
162 aa  321  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  51.55 
 
 
165 aa  187  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  51.88 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55 
 
 
163 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  53.75 
 
 
174 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  53.12 
 
 
174 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  49.69 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.2 
 
 
163 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  45.62 
 
 
161 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  50.29 
 
 
178 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.06 
 
 
163 aa  140  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.48 
 
 
162 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  48.77 
 
 
165 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.04 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  49.03 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 
163 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 
163 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.24 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  48.12 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.69 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.38 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.01 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45 
 
 
168 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 
163 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.1 
 
 
162 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.68 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.96 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  43.12 
 
 
172 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.75 
 
 
171 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.27 
 
 
163 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.75 
 
 
171 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.27 
 
 
163 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.67 
 
 
157 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  41.46 
 
 
162 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.48 
 
 
163 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.1 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.61 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.61 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.99 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.67 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.07 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  36.02 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.65 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.37 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.37 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.75 
 
 
171 aa  94.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.99 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.37 
 
 
162 aa  90.5  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  36.02 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  34.78 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.26 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 
162 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  35.4 
 
 
162 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.72 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  37.16 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.54 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.45 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  35.04 
 
 
157 aa  84  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  30.91 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.56 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.76 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.72 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.8 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.8 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  40.78 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  38 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.48 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.92 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  33.33 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  36.42 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.56 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  43.68 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  36.08 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  31.68 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  28.9 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.7 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  43.82 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  33.33 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.63 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.5 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.22 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  29.11 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.63 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  30.46 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  38.46 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  42.71 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  36.84 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  32.67 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  26.03 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  28.46 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  39.71 
 
 
117 aa  58.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>