144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0494 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
163 aa  317  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  49.38 
 
 
163 aa  173  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  50.92 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  55 
 
 
162 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.7 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  48.15 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.65 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  46.39 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  53.8 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.44 
 
 
163 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.34 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.34 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 
163 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 
163 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.83 
 
 
165 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  42.86 
 
 
165 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  46.88 
 
 
167 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.75 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.34 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  43.04 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.94 
 
 
178 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.67 
 
 
166 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 
162 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.49 
 
 
164 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.59 
 
 
168 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.49 
 
 
163 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.49 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.58 
 
 
162 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 
168 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  48.12 
 
 
172 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.25 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.4 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  40.74 
 
 
162 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.97 
 
 
157 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  36.02 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.45 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.38 
 
 
171 aa  97.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.88 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.88 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.48 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.75 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.35 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  36.02 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.88 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  40 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.08 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.18 
 
 
158 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  33.33 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.03 
 
 
157 aa  87.8  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.5 
 
 
156 aa  87.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  35.46 
 
 
157 aa  87  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.03 
 
 
158 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  32.5 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.95 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.74 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.85 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  37.62 
 
 
115 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.04 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  36.63 
 
 
115 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  35.33 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  34.04 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.81 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  37.8 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  34.38 
 
 
198 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.04 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.04 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  33.33 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.59 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.82 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  32.94 
 
 
201 aa  73.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  31.37 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.68 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.8 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.79 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  37.37 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.65 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.65 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  43.96 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.84 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.84 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  27.21 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.04 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  27.63 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  27.21 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  33.85 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0649  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.84 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.84 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00164571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  24.5 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  46.03 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  40.78 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  28.7 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.85 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.88 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>