90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3474 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  100 
 
 		 162 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  91.36 
 
 		 162 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  72.84 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  71.6 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  70.37 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  69.75 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  70.99 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  54.27 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.38 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.38 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.77 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  50.62 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.83 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.15 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.89 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.21 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  43.54 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  39.13 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  51.85 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.48 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  37.27 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  37.04 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.89 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  40.74 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  40.99 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.41 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.41 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.58 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  35.44 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  39.75 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.65 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  37.41 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.25 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.1 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.1 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.36 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.72 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.86 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.24 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.54 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  40.12 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.54 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.88 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  35 
 
 		 161 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.95 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.63 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 		 162 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  35.8 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.99 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  38.18 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.63 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.93 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.88 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  34.36 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.39 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  36.02 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.81 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.37 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  30.77 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.78 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  28.29 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  26.11 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  29.41 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.31 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1356  monovalent cation/proton antiporter, subunit of MnhE/PhaE family protein  34.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.742523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  26 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.61 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  31.5 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  24.14 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.19 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  30.77 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  24.76 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.77 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.77 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  24.05 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.38 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  23.81 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  29.79 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.94 
 
 		 191 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  31.43 
 
 		 111 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  34.62 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.45 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>