82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1797 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  100 
 
 		 170 aa  327  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  61.76 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  42.77 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30380  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  41.57 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.76 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  29.24 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.81 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.44 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.79 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.83 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.75 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.75 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.22 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.96 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.12 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.82 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  36.73 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.68 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  31.58 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.52 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  32.63 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.87 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  31.53 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  27.78 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.72 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.72 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  26.26 
 
 		 115 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  26.26 
 
 		 115 aa  51.6  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  27.1 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  27.45 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  26.55 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.11 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  25.66 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.11 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  24.42 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  27.89 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.43 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.86 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.22 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.71 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.43 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.03 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.93 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.92 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.44 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.91 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  32.41 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  37.5 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.58 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.87 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.58 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.58 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  29.21 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.84 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.84 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.17 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  36.36 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.29 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.43 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  27.27 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.84 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.34 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  28.8 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.37 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  29.35 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  28.79 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.34 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.35 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  29.82 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.36 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.07 
 
 		 162 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.58 
 
 		 162 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.58 
 
 		 162 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.79 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1430  cation antiporter  28.72 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>