116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0229 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
163 aa  322  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  87.12 
 
 
163 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  87.12 
 
 
163 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  64.81 
 
 
163 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  57.67 
 
 
163 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  57.06 
 
 
165 aa  187  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.17 
 
 
163 aa  187  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.77 
 
 
162 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  53.75 
 
 
162 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.12 
 
 
162 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  45.4 
 
 
162 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  38.51 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.06 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  38.27 
 
 
163 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  42.86 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.34 
 
 
163 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  43.21 
 
 
172 aa  101  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  40.37 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.08 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  37.34 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  35 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.03 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  38.36 
 
 
167 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  39.13 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.5 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.65 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.76 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  38.12 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.29 
 
 
178 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.25 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.25 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  35 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.8 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.08 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.11 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.87 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  32.5 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.45 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.24 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  33.79 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.65 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.45 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.45 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.41 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  31.68 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.92 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.93 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.56 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.46 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.51 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.12 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  32.3 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.81 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.93 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.78 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  38.79 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.9 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  33.55 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.33 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.92 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.95 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  30.97 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  47.62 
 
 
111 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  30.25 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.21 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  31.58 
 
 
115 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  28.75 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  31.58 
 
 
115 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.29 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.28 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  30.13 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.79 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  29.75 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.79 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28.37 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.71 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.06 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  24.68 
 
 
172 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  33.06 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  26.92 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.84 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.84 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  27.1 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  26.24 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  25.37 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.63 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  29.88 
 
 
198 aa  48.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  29.06 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.93 
 
 
191 aa  47.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30380  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.61 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  26.03 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>