140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0752 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  100 
 
 
157 aa  316  7e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  76.43 
 
 
157 aa  244  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  59.24 
 
 
157 aa  197  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  55.41 
 
 
157 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  54.09 
 
 
159 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  50 
 
 
157 aa  147  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.05 
 
 
157 aa  141  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.08 
 
 
157 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.71 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  45.68 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.03 
 
 
157 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.52 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  44.1 
 
 
158 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  44.08 
 
 
158 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  54.72 
 
 
111 aa  124  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.81 
 
 
156 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  43.92 
 
 
158 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.11 
 
 
157 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  41.36 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.51 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  50 
 
 
115 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  49 
 
 
115 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.14 
 
 
157 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.16 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.55 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.62 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  35.9 
 
 
198 aa  94.7  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  34.04 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.14 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  45.36 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.1 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.1 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  32.53 
 
 
201 aa  85.1  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.41 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.62 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  34.92 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.21 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  37.14 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.93 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  38.89 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  32.17 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  37.04 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  29.66 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.78 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  32.3 
 
 
219 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.48 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  37.76 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.87 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.47 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.19 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  35.16 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.94 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  29.53 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  29.37 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  31.58 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  32 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.52 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11080  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  32.38 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.53 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  33.33 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.61 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26960  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  39.81 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.42 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  36.72 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0649  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.72 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.72 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00164571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  40.91 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  30.08 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  27.41 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  29.82 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  25.69 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.37 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.83 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.42 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  28.24 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  28.95 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.46 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.05 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.17 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.17 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  31.13 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.66 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.97 
 
 
202 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.25 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  31.09 
 
 
195 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.6 
 
 
179 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.38 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  28.87 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  33.33 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  28.89 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.28 
 
 
162 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0044  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  34.85 
 
 
107 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.71 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  29.49 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  27.27 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>