70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0497 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  100 
 
 
188 aa  363  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  39.43 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  40.34 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  38.85 
 
 
239 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  43.18 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  41.94 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.43 
 
 
191 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 
202 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  45.06 
 
 
203 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.31 
 
 
181 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  39.51 
 
 
205 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  35.62 
 
 
170 aa  94.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  34.71 
 
 
205 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.24 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.38 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  44.17 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  35.98 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  41.18 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.76 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.76 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.76 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.08 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  34.38 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  38.85 
 
 
233 aa  82  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30.77 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  32.64 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  29.41 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  33.08 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.79 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28.79 
 
 
157 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.05 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
157 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  26.09 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  31.82 
 
 
157 aa  54.7  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.94 
 
 
157 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
157 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  29.27 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  35.71 
 
 
117 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  30 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  31.82 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  25.95 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.13 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.85 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  30.07 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.61 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.61 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.2 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  34.09 
 
 
111 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  23.48 
 
 
219 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.97 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.68 
 
 
164 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  30.39 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.31 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  24.84 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  27.21 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  25.27 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  32.41 
 
 
133 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  32.46 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.94 
 
 
157 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  31.11 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  27.41 
 
 
159 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0044  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  37.31 
 
 
107 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.21 
 
 
158 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.08 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  40 
 
 
125 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  33.33 
 
 
129 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  25.34 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  24.77 
 
 
172 aa  41.2  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.88 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>