42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  38.51 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  31.88 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.96 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  30.18 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.74 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  32.94 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  31.25 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  27.93 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  34.38 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.21 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.9 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.79 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.12 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  30.82 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  26.11 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.03 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  26.95 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  28.57 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.15 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  26.99 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  29.27 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  27.34 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  28.86 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.86 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.79 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.27 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.81 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.77 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  28.09 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  21.37 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  21.24 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  22.67 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.78 
 
 		 157 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  25.61 
 
 		 117 aa  41.2  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.12 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  22.22 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>