67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0668 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  100 
 
 		 239 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  56.12 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  54.49 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  54.49 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.11 
 
 		 189 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  51.14 
 
 		 179 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  51.14 
 
 		 179 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  37.34 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  36.36 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  36.65 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.48 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  38.85 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.39 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  32.41 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  29.38 
 
 		 170 aa  89  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  34.46 
 
 		 180 aa  88.2  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  33.1 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  34.52 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.41 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30.94 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  35.63 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  28.48 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  34.03 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.43 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  29.25 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  30.6 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  26.67 
 
 		 157 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  23.72 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  30.4 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  26.09 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  24.46 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 		 157 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.17 
 
 		 159 aa  48.9  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  29.69 
 
 		 162 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  25.74 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.79 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.4 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.95 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  25.93 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  20.89 
 
 		 172 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.07 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.47 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  30.37 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  33.82 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.28 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.02 
 
 		 162 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  25.19 
 
 		 157 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  26.95 
 
 		 171 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  23.08 
 
 		 158 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  28.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  28.24 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.05 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.28 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.65 
 
 		 156 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  24.46 
 
 		 162 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.19 
 
 		 160 aa  42  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.7 
 
 		 162 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.01 
 
 		 164 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.92 
 
 		 344 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  27.78 
 
 		 167 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.9 
 
 		 158 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>