101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1850 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 		 162 aa  314  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  95.06 
 
 		 162 aa  259  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  94.44 
 
 		 162 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  85.8 
 
 		 162 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  71.6 
 
 		 162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  71.6 
 
 		 162 aa  204  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  72.22 
 
 		 162 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  54.32 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.77 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.91 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.77 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.77 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  51.23 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.91 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  45.58 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.91 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  42.24 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  54.32 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.51 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  43.83 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.37 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.37 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.83 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.27 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  41.61 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  42.24 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.56 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.56 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.93 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.71 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  33.74 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  38.04 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.67 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.75 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.48 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.65 
 
 		 163 aa  97.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  36.69 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.78 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.78 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.38 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  32.52 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.89 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  40.24 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.78 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  35.62 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.26 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.95 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  37.04 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.07 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.4 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  36.42 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.3 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  40.13 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.84 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.06 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.65 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.26 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  38.04 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.17 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.74 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.48 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.97 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.13 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  30.26 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.43 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.37 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.71 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.69 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.06 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  26.62 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  30.54 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  34.48 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  33.77 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.22 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.22 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2618  hypothetical protein  29.52 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  28.05 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  31.63 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  24.14 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  27.39 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28.91 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  36.84 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30.89 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  29.36 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.54 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.35 
 
 		 189 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.35 
 
 		 189 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1356  monovalent cation/proton antiporter, subunit of MnhE/PhaE family protein  29.85 
 
 		 80 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.742523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.35 
 
 		 189 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  26.67 
 
 		 115 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  31.85 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  25.97 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  25.71 
 
 		 115 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  32.26 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.66 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.23 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>