87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4627 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.44 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  35.98 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  31.17 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.67 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.67 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  36.24 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.64 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  25.64 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  32.45 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.38 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.13 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  28.48 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.74 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  35.71 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.47 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  36.42 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.48 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.48 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.48 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  31.07 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  33.93 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.44 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.03 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.03 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.66 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  29.75 
 
 
199 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.97 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  32.05 
 
 
183 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.17 
 
 
162 aa  54.3  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  35.9 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  24.83 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  27.94 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  30.83 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  26.04 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.03 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.58 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  27.08 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  26.09 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.52 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.93 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  23.42 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.14 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.35 
 
 
206 aa  48.5  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.79 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.83 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.53 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  30.34 
 
 
165 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  25.49 
 
 
201 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.37 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  28.45 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.16 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.48 
 
 
162 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  23.81 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.3 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.32 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11080  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.53 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.61 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  29.46 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  28.26 
 
 
115 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  27.7 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.61 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  32.26 
 
 
219 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  28.26 
 
 
115 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.32 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.62 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.67 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.3 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  28.57 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.84 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  24.73 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  31.73 
 
 
111 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  28.97 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.22 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.45 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  29.59 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  27.45 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.76 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  29.73 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.84 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.84 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0044  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  34.18 
 
 
107 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  27.06 
 
 
129 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  26.49 
 
 
205 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  27.71 
 
 
173 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>