60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3657 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
181 aa  357  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  75.14 
 
 
181 aa  281  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  42.77 
 
 
205 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.04 
 
 
202 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  36.99 
 
 
207 aa  104  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  37.2 
 
 
190 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.86 
 
 
205 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  33.55 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  39.1 
 
 
180 aa  89  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32 
 
 
170 aa  84.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  38.24 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  33.33 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  31.11 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.13 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  38.86 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  36.13 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  28.03 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  31.74 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.4 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.4 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.4 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  28.97 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.97 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  34.81 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.41 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  32.24 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.07 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.97 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  28.87 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  29.92 
 
 
219 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  26.43 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  27.73 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.9 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  26.92 
 
 
115 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  28.28 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  26.55 
 
 
198 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.75 
 
 
157 aa  47.8  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  28.26 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  26.92 
 
 
115 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
157 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.69 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  25.48 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.5 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.73 
 
 
157 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.21 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  25.45 
 
 
125 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.17 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.17 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  27.81 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  22.15 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  27.36 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  24.68 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.09 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  20.69 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  27.1 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.59 
 
 
157 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.36 
 
 
157 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>