37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  100 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  37.27 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.71 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  32.72 
 
 		 239 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.61 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  36.97 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.08 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  33.12 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.84 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  35.37 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.57 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.57 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  36.84 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.59 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.55 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  34.23 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  37.68 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  29.86 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  28.75 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  27.89 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  30.22 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.27 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  31.71 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  30.19 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  31.39 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.59 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.01 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  32.08 
 
 		 117 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  31.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  24.64 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  36.17 
 
 		 125 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.95 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.84 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  26.28 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>