94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3717 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  100 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  56.12 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.21 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.21 
 
 
189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.29 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  53.29 
 
 
179 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  52.26 
 
 
179 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.42 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  35.12 
 
 
190 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  36.91 
 
 
193 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  33.73 
 
 
207 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.88 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.31 
 
 
181 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.21 
 
 
181 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.7 
 
 
170 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  33.59 
 
 
180 aa  82  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  31.72 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  36.6 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  29.38 
 
 
205 aa  79  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  38.85 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  34.36 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.91 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  38.64 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  36.42 
 
 
174 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.54 
 
 
186 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.91 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28.86 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  33.33 
 
 
159 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.78 
 
 
157 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  27.08 
 
 
157 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  26.32 
 
 
157 aa  62  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.21 
 
 
157 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.59 
 
 
159 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.59 
 
 
159 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.19 
 
 
158 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.06 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  28.89 
 
 
158 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
157 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
159 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.12 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  32.48 
 
 
158 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.38 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  27.01 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  32.22 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  32.18 
 
 
159 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.53 
 
 
156 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.33 
 
 
160 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.82 
 
 
157 aa  55.5  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.03 
 
 
158 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  28.36 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.25 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  22.16 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  30 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.21 
 
 
163 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.78 
 
 
157 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.21 
 
 
163 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  32.26 
 
 
170 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.79 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  26.02 
 
 
205 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.99 
 
 
159 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.43 
 
 
162 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.64 
 
 
157 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  30.11 
 
 
111 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  32.05 
 
 
125 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.37 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  26.92 
 
 
161 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  28.24 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  28.57 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  28.39 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  33.78 
 
 
117 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  31.71 
 
 
174 aa  45.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  24.49 
 
 
175 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0044  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  31.08 
 
 
107 aa  45.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.76 
 
 
174 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.76 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.78 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  27.66 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.53 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  25.32 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  25.85 
 
 
182 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  31.9 
 
 
165 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  30.68 
 
 
162 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.67 
 
 
167 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
163 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  25.17 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.41 
 
 
174 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.86 
 
 
344 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  30.67 
 
 
167 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.77 
 
 
157 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.48 
 
 
162 aa  42  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  24.36 
 
 
165 aa  42  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  28.42 
 
 
129 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.45 
 
 
158 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>