37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6652 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  100 
 
 
183 aa  344  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.44 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  41.61 
 
 
207 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.94 
 
 
202 aa  100  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  39.61 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  37.72 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  43.71 
 
 
188 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  35.63 
 
 
239 aa  88.2  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  38.55 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  34.42 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.06 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  34.36 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  34.97 
 
 
205 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  35.53 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.81 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  34.69 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.03 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  39.1 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.12 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.12 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.12 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  27.38 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.79 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  30.97 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  28.1 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.37 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.76 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.52 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.81 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  31.79 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  26.45 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  26.53 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  26.42 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.69 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.58 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  28.08 
 
 
158 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>