62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5211 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  100 
 
 		 203 aa  380  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  45.09 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  38.37 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.96 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  36.36 
 
 		 170 aa  95.5  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  35.4 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  35.09 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  38.85 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  34.88 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  36.48 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  36.18 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  37.58 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.49 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  29.78 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  33.54 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.13 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.26 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.96 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  34 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  38.33 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.71 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.87 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.87 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.87 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.36 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.79 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  37.19 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  29.03 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  30.61 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.72 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.78 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  30.83 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.99 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  30.84 
 
 		 117 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.34 
 
 		 157 aa  52  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  28.57 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.83 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  31.03 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  33.33 
 
 		 111 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  29.75 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  26.03 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.04 
 
 		 157 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  29.08 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.75 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  26.45 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.08 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  23.42 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.08 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.09 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  33.78 
 
 		 115 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.1 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  33.78 
 
 		 115 aa  44.7  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.89 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.22 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.59 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0044  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  37.04 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  30 
 
 		 125 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.04 
 
 		 157 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  32.33 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  21.74 
 
 		 165 aa  41.2  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>