143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0564 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  55.93 
 
 
201 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  53.41 
 
 
219 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.5 
 
 
164 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  35.9 
 
 
157 aa  94.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.69 
 
 
158 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.86 
 
 
157 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 
157 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.91 
 
 
160 aa  88.2  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.85 
 
 
155 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.48 
 
 
157 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  38.18 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  32.3 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.47 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  40.18 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.41 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  35.45 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.64 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.55 
 
 
344 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  47.3 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  33.33 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.46 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.54 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  32.12 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.67 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.67 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  30.06 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  35.66 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.59 
 
 
163 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  34.48 
 
 
172 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  43.96 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.88 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  31.68 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  33.81 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.3 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  24.7 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  42.86 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  46.05 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  35.25 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  44 
 
 
117 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  32.76 
 
 
125 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  53.33 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  28.97 
 
 
161 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.17 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.97 
 
 
421 aa  65.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  50 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  31.82 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.04 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  33.12 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  28.17 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  28.1 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  33.96 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  29.38 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.8 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.2 
 
 
159 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.67 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  29.2 
 
 
159 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  30.63 
 
 
111 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.18 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.73 
 
 
100 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1204  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.8 
 
 
100 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.156965  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  35.54 
 
 
344 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  35.14 
 
 
133 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.08 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.8 
 
 
100 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.09 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.78 
 
 
100 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  34.88 
 
 
173 aa  58.2  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.03 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  34.65 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  29.27 
 
 
162 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  33.78 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0649  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.98 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.98 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00164571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  31.82 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  31.07 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  32.22 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  28.89 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  31.82 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  28.68 
 
 
168 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.74 
 
 
160 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  31.4 
 
 
202 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  28.57 
 
 
205 aa  54.7  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.45 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.48 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.45 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.34 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1363  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.69 
 
 
101 aa  53.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  27.45 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.19 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  33.71 
 
 
161 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.66 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.19 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  34.21 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  28.57 
 
 
183 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  30.23 
 
 
139 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.52 
 
 
176 aa  51.2  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>