143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0878 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
157 aa  310  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  84.71 
 
 
157 aa  247  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  66.88 
 
 
157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  66.24 
 
 
157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  58.67 
 
 
158 aa  157  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.59 
 
 
157 aa  144  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.75 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.59 
 
 
157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.86 
 
 
157 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.51 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  45.28 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.16 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.97 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  41.77 
 
 
157 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.5 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  42.41 
 
 
158 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  39.87 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  38.61 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  45.62 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  40.51 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  39.62 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.58 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  41.38 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  38.18 
 
 
170 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.77 
 
 
159 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.77 
 
 
159 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.28 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  51.69 
 
 
111 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  41.51 
 
 
115 aa  94  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  40.57 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  40.2 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  34.44 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  38.54 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  35.46 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  32.08 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  31.65 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  37.78 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  29.94 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  30.94 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.68 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  34.19 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  36.25 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.58 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.12 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.32 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.06 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.63 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.67 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  29.14 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.46 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.66 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.97 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  31.33 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3144  cation antiporter  33.33 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.85 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  29.61 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.84 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  28.57 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  29.5 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.61 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.62 
 
 
174 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.63 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.62 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  31.69 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  29.14 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  34.52 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.95 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  28.75 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.95 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  28.3 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.31 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.56 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.71 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  30 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.71 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  49.15 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  30.19 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.36 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  30 
 
 
233 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  30.19 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  33.1 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  27.7 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0649  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.71 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.71 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00164571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  34.52 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.71 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.62 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  28.67 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.17 
 
 
344 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.92 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  31.76 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 
162 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
181 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  28.76 
 
 
190 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  27.52 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>