84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2281 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  100 
 
 		 173 aa  343  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  44.3 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  45.45 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2973  cation antiporter  43.71 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  43.38 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  40.36 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  35.57 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  27.08 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  33.13 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  34.23 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  29.48 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.56 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  36.56 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.71 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  34.45 
 
 		 344 aa  64.7  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.81 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.81 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.58 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.79 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.28 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  36.36 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  32.91 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  32.59 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0175  hypothetical protein  26.9 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  33 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.21 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.9 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  35.06 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  31.72 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  34.58 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.04 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.49 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  29.14 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  34.57 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.04 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  26.81 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.37 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.97 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.97 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  29.7 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.83 
 
 		 421 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.52 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  33.75 
 
 		 117 aa  52.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0944  Na+/H+ ion antiporter family protein  25.38 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  34.38 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  23.57 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  30.34 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  30.59 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  31.25 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  30.61 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  31.33 
 
 		 115 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  29.63 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.37 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  29.36 
 
 		 111 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  36.78 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  28.16 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.88 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01530  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  30.56 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  28.92 
 
 		 115 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.03 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  34.15 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  30.85 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  30.53 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.76 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  28.42 
 
 		 123 aa  44.7  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  30.69 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  27.27 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.47 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0519  hypothetical protein  31.5 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  29.41 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.73 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.19 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.4 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1109  cation antiporter  30 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.218767  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.4 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.8 
 
 		 100 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  27.59 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  26.19 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.57 
 
 		 100 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>