24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0714 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  97 
 
 
100 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1204  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  97 
 
 
100 aa  193  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.156965  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  84 
 
 
100 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1363  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  77.55 
 
 
101 aa  158  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  39.8 
 
 
198 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  42.67 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  38.67 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  31.13 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  36.73 
 
 
201 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  33.66 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  32.35 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  29 
 
 
172 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  45.28 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  30.85 
 
 
202 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.93 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  42.86 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  32.65 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  39.66 
 
 
195 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  52.63 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  38.57 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  38.1 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.53 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>