131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1210 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  59.38 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.69 
 
 
155 aa  187  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  45.22 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  42.33 
 
 
174 aa  121  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  41.06 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  36.02 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  38.84 
 
 
201 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.55 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  40.91 
 
 
198 aa  88.2  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  37.5 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  34.04 
 
 
202 aa  85.1  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.31 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.31 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.81 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  34.87 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  34.57 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.56 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.78 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  39.81 
 
 
168 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  32.26 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  35.9 
 
 
344 aa  74.7  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.89 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.97 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  38.26 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  32.08 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  30.66 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  34.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  35.9 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
421 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  29.53 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  33.73 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.54 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.67 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  34.48 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  36.55 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  34.19 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.36 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  31.43 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  38.37 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  37.27 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  45.57 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  41.56 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  43.94 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  32.85 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  31.62 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.66 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.76 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.02 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  31.61 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  35.85 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.01 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  30.61 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  30.41 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.37 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.37 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.73 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.01 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  33.71 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.71 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  31.01 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  28.67 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.73 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  32.52 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.74 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  27.94 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.68 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.5 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  35.64 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  26 
 
 
233 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  34.69 
 
 
129 aa  54.7  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  28 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  35.96 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.63 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.67 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0649  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 
160 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 
160 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00164571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  26.4 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.07 
 
 
178 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  30.61 
 
 
177 aa  51.2  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  32.56 
 
 
111 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.17 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  27.03 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0175  hypothetical protein  28.24 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  30.93 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.03 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.63 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.67 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.03 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.86 
 
 
100 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  35.14 
 
 
133 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.26 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01530  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  25.93 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.26 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>