82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2168 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  34.34 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
344 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.04 
 
 
160 aa  85.1  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  41.75 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  40.59 
 
 
161 aa  82  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  32.69 
 
 
167 aa  79  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  36.79 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  33.1 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2973  cation antiporter  34.16 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0727483 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  26.9 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  31.67 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.11 
 
 
164 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.8 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.92 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  27.92 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  28.75 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  26.67 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  23.33 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.1 
 
 
421 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  30.6 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.17 
 
 
159 aa  62.4  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.22 
 
 
157 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  31.08 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  28.19 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  32.93 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  29.58 
 
 
162 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  31.4 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.17 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  30.61 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.76 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  28.1 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  24.05 
 
 
158 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  30 
 
 
182 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  30.23 
 
 
161 aa  52.4  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  34.58 
 
 
111 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.67 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  31.01 
 
 
157 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0175  hypothetical protein  23.26 
 
 
158 aa  52  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  31.31 
 
 
159 aa  51.6  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.66 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  29.84 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  28.03 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  24.59 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.85 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.32 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  25.45 
 
 
177 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  28.93 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.9 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.03 
 
 
163 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.42 
 
 
162 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.27 
 
 
157 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.03 
 
 
163 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.33 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0944  Na+/H+ ion antiporter family protein  29.13 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.33 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.34 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.23 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1204  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.85 
 
 
100 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.156965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.53 
 
 
157 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.09 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.85 
 
 
100 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.85 
 
 
100 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  30.39 
 
 
117 aa  44.7  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  29.57 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.32 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  29.17 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  27.78 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  24.65 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  31.51 
 
 
115 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  21.53 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.67 
 
 
100 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.04 
 
 
162 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  20.73 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.12 
 
 
163 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  20.73 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.22 
 
 
168 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  26.6 
 
 
219 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0519  hypothetical protein  28.38 
 
 
158 aa  42  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.77 
 
 
162 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  34.25 
 
 
175 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  27.47 
 
 
164 aa  41.6  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>