28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0109 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
100 aa  199  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  97 
 
 
100 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1204  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  97 
 
 
100 aa  193  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.156965  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  85 
 
 
100 aa  174  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1363  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  76.53 
 
 
101 aa  157  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  38.78 
 
 
198 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  32.08 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  37.33 
 
 
175 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  45 
 
 
173 aa  53.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  33.33 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  35.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  33.66 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  28 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  30.85 
 
 
202 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  45.28 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  39.44 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.9 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  34.44 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  31.63 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.84 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.53 
 
 
157 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  34.25 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  28.05 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  35.21 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  37.14 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  26.97 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  37.93 
 
 
195 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>