67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3453 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  100 
 
 
349 aa  702    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  71.63 
 
 
344 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.54 
 
 
421 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.63 
 
 
344 aa  264  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  35.19 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  36.79 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.91 
 
 
155 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  33.09 
 
 
161 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  33.09 
 
 
168 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  35.33 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  36.56 
 
 
173 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.37 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  33.12 
 
 
198 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  42.86 
 
 
167 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.32 
 
 
159 aa  63.5  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  33.88 
 
 
195 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.3 
 
 
164 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  34.29 
 
 
171 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  35.24 
 
 
159 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  32.88 
 
 
201 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  31.16 
 
 
175 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  30.85 
 
 
166 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  35.48 
 
 
177 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  37.23 
 
 
159 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  38.98 
 
 
161 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.93 
 
 
163 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  34.74 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.32 
 
 
159 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.32 
 
 
159 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.35 
 
 
156 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2973  cation antiporter  34.72 
 
 
157 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0727483 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.96 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.04 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  34.48 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  33.33 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.25 
 
 
165 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  33.33 
 
 
129 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.46 
 
 
166 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.48 
 
 
157 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  35.71 
 
 
133 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  31.15 
 
 
219 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.86 
 
 
157 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  32.69 
 
 
157 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36 
 
 
156 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.3 
 
 
158 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  31.36 
 
 
125 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  28.57 
 
 
183 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  35.8 
 
 
170 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.66 
 
 
163 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  29.32 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.14 
 
 
163 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  32.39 
 
 
117 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  26.4 
 
 
164 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  30.16 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  26.92 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.14 
 
 
163 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0175  hypothetical protein  30.23 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.29 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  30 
 
 
165 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  28.48 
 
 
190 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  35.44 
 
 
162 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
157 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  29.37 
 
 
157 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  27.71 
 
 
115 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.71 
 
 
158 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  24.32 
 
 
182 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>