124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3815 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
178 aa  352  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  55.56 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  49.11 
 
 
165 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.66 
 
 
166 aa  147  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  50.29 
 
 
162 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  47.62 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  47.37 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  41.18 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.53 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.11 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  40.12 
 
 
167 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 
168 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.24 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.22 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.1 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  39.77 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.03 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.94 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.15 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.88 
 
 
163 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  38.1 
 
 
162 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.08 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.43 
 
 
163 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.82 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.43 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.72 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.88 
 
 
162 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.69 
 
 
163 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.69 
 
 
163 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.35 
 
 
173 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  36.69 
 
 
162 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  37.5 
 
 
162 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.31 
 
 
158 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.7 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.29 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.09 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.18 
 
 
162 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.15 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  37.79 
 
 
162 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.14 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.14 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  43.2 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.66 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  34.81 
 
 
172 aa  87.8  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.87 
 
 
162 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.71 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.64 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.5 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.6 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.24 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.24 
 
 
162 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.99 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.9 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.26 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.16 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.74 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.68 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.84 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.26 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.63 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.49 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.51 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.88 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.43 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  32.94 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.94 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  27.78 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  28.39 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  33.91 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  30.82 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  35.09 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  33.04 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.25 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.07 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  26.14 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.61 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.41 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  29.48 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.95 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  27.65 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.14 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  31.58 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.38 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  28.65 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  27.62 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1356  monovalent cation/proton antiporter, subunit of MnhE/PhaE family protein  42.25 
 
 
80 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.742523  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  26.83 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  33.01 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  29.3 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.25 
 
 
157 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.07 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.07 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  29.59 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  31.4 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.46 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.95 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  27.1 
 
 
111 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  25 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  30.69 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>