33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0779 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
100 aa  197  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0109  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  85 
 
 
100 aa  174  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0568073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1204  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  85 
 
 
100 aa  173  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.156965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  84 
 
 
100 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1363  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  72.73 
 
 
101 aa  149  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  36.73 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  46.67 
 
 
173 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  40 
 
 
175 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  35.24 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  33.67 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  32.99 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  32.35 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.86 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  29.63 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  36.92 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  43.4 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.96 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  36.99 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.16 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  36.67 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  32.43 
 
 
219 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  30 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 
155 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  52.63 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  35.29 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  35.71 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  33.33 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.5 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  36.62 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.5 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  32.65 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>