84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1641 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  100 
 
 		 161 aa  307  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2973  cation antiporter  44.94 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  40.51 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  43.38 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  40.88 
 
 		 167 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  42.04 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  39.31 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  40.59 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  38.46 
 
 		 344 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.54 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  32.56 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.87 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.52 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  33.09 
 
 		 349 aa  71.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.62 
 
 		 421 aa  71.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  33.77 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  28.77 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.5 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.14 
 
 		 344 aa  67.4  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.46 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  31.68 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  34.69 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  32.43 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0175  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  34.09 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  31.85 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.91 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.26 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  31.37 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  34.07 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  34.12 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.79 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.71 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  34.65 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.64 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  31.76 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  34.03 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  27.89 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.19 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  36 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.58 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  35.24 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  36.25 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.18 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  33.33 
 
 		 111 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  33.04 
 
 		 129 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  32.67 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.11 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  30.77 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  31.19 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  30.95 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.44 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  30.1 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.48 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  35.51 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  32.58 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.2 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  26.47 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  32.37 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.11 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  33.67 
 
 		 123 aa  47.8  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  33.77 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  39.76 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  27.17 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.48 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  34.94 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.03 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  24.09 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.89 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0944  Na+/H+ ion antiporter family protein  27.82 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.43 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  28.39 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.63 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  32.94 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1204  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.26 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.156965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.35 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  31.46 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0714  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  52.63 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.485735 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0779  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  52.63 
 
 		 100 aa  41.2  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.745565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.58 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.67 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.01 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.89 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.89 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>