61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1916 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  100 
 
 		 123 aa  253  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11080  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  55.28 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26960  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  57.76 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  38.89 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  37.04 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  37.04 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3454  cation antiporter  39.42 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  35.19 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  38.05 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.61 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  34.55 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  35.19 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.45 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.11 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.86 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  31.86 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  31.86 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  34.86 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  34.26 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  31.9 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.26 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  35.29 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.3 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  33.66 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.73 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.39 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.44 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.09 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  32.38 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.91 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.07 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.02 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.52 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.52 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.03 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  33.67 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  36.76 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  27.84 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  27.55 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  32.43 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.22 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  32.14 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  28.42 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.91 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  33.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.72 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  28.57 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  30.93 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.61 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  35.16 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  32.53 
 
 		 159 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.73 
 
 		 157 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.43 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.38 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  32.94 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  32.5 
 
 		 349 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  26.09 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>