111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0673 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 		 162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  80.25 
 
 		 162 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  77.78 
 
 		 162 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  58.02 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.97 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.5 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.5 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.43 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.06 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.12 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  45.28 
 
 		 165 aa  157  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  50.31 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  50 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  41.1 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  39.75 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  40.88 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  40.13 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  37.89 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.18 
 
 		 178 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  41.61 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.34 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.49 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.37 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.62 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.76 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.68 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.89 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.25 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  39.04 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  36.81 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  32.92 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  40 
 
 		 167 aa  90.5  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.99 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.27 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.55 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  30.72 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 		 163 aa  87.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  33.54 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.16 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.04 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  32.3 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.68 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.02 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.4 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.92 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.32 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.15 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.15 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.78 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.52 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.77 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.1 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.19 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  29.22 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.29 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.22 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.87 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  32.71 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.45 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  32.71 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  36.08 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  27.81 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  40 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.21 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.29 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.29 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  27.52 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.45 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.68 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  31.87 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  29.8 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.1 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.75 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  29.14 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.1 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  32.12 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  27.46 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  26.71 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.86 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  26.49 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  25 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.68 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  29.41 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  27.81 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  26.47 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  24.81 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.79 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  28.35 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  25.55 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>