52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3279 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  100 
 
 		 177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  81.53 
 
 		 159 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  76.79 
 
 		 171 aa  243  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  44.53 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  41.3 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2973  cation antiporter  36.84 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  38.36 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  29.93 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  35.51 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0175  hypothetical protein  30.52 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0944  Na+/H+ ion antiporter family protein  31.13 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  35.48 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  37.08 
 
 		 344 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.85 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  30.99 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  30 
 
 		 172 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.33 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  29.9 
 
 		 115 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  33.01 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  29.52 
 
 		 115 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.39 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.49 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  25.45 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.17 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  27.11 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.95 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.95 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  31.13 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.24 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  27.41 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.94 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.48 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.1 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  29.7 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  31.31 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.63 
 
 		 421 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.71 
 
 		 344 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  29.93 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1363  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.49 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.45 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.58 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  38.04 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  33.78 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.92 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.39 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0519  hypothetical protein  26.87 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  27.85 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.86 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  23.76 
 
 		 129 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>