17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0519 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0519  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  313  5e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  31.75 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  35.37 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  26.87 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  28.38 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  26.28 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2973  cation antiporter  26.67 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0727483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  25.9 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  30.77 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  24.46 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  29.29 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  31.9 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0944  Na+/H+ ion antiporter family protein  22.84 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  28.57 
 
 
349 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  23.87 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.46 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.46 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>