35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0738 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  41.73 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  43.7 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  34.97 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  38.71 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  44.33 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01530  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  40.65 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  37.14 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  40 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.65 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  30.3 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  34.34 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  35.96 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  34.94 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.68 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  33.33 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  29.03 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  34.92 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  26.4 
 
 
349 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  30.53 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  32.14 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.79 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.18 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  30.69 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  28.74 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  28.28 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.43 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.62 
 
 
166 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  35.25 
 
 
172 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  27.47 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.1 
 
 
158 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  30.14 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.79 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  34.92 
 
 
344 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.07 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>