112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1588 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
162 aa  323  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  55.28 
 
 
162 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  54.29 
 
 
162 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.44 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.44 
 
 
163 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  43.98 
 
 
172 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.77 
 
 
163 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  44.59 
 
 
162 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.38 
 
 
162 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.06 
 
 
164 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  46.31 
 
 
162 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  45.27 
 
 
162 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.48 
 
 
171 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.48 
 
 
171 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.73 
 
 
168 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.99 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  41.36 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.52 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.51 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.83 
 
 
163 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.53 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  38.85 
 
 
165 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  42.68 
 
 
162 aa  104  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.18 
 
 
162 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  43.21 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.04 
 
 
162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  41.36 
 
 
161 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.04 
 
 
162 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.04 
 
 
162 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.34 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.68 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.03 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.04 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  47.52 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.08 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.18 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.38 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  43.38 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.88 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.65 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.13 
 
 
163 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  39.16 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.73 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.25 
 
 
163 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  40 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  38.27 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.42 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.42 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  33.8 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  43.48 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.66 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.25 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.57 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.87 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.3 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  44.66 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  47.37 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.34 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.65 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.76 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.48 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  40 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.15 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.53 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.81 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  31.48 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  30.56 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.04 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.92 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.54 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.66 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  28.38 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  33.33 
 
 
111 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  25.66 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  28 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.38 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.03 
 
 
157 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.12 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.61 
 
 
157 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  28 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  29.46 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  32.11 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  26.06 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.92 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  32 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  29.24 
 
 
201 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1206  cation antiporter  30.51 
 
 
173 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0203204 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.15 
 
 
160 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  27.89 
 
 
157 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  26.75 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1797  cation antiporter  32.84 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.525792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  27.27 
 
 
233 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  22.38 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  22.29 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  25.58 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>