33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4889 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  866    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  47.42 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  46.71 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  40.64 
 
 		 433 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.22 
 
 		 561 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.02 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  39.6 
 
 		 449 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  37.76 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.81 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  40.36 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.5 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 944 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  33.99 
 
 		 946 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  32.87 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  33.65 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  31.38 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  34.67 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  39.34 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  38.16 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 967 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  32.57 
 
 		 935 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  32.26 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  28.42 
 
 		 930 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  32.85 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  39.29 
 
 		 507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  35.45 
 
 		 533 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 564 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  42.05 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  40.26 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  33.94 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.27 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  30.19 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>