62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3510 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  100 
 
 
225 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  35.47 
 
 
234 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  36.22 
 
 
216 aa  92  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0951  YhhN family protein  33.72 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  37.7 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  32.97 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  35.06 
 
 
626 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  35.6 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  30.37 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  28.78 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  30.93 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  33.33 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  29.07 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  32.22 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  31.75 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  33.33 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  29.07 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  30.46 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  31.37 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  32.34 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  31.79 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  28.23 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  34.01 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  36.13 
 
 
597 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  36.13 
 
 
597 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  35.16 
 
 
233 aa  61.6  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  28.66 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  28.4 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  29.23 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  27.75 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  27.23 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  27.75 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  31.74 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  31.74 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  31.74 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  31.74 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  31.93 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  31.74 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  32.61 
 
 
143 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  28.74 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  31.93 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  28.74 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  30.63 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  27.44 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  33.33 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1936  YhhN family protein  27.64 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  29.63 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  28.99 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  27.75 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0456  YhhN family protein  40.74 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.556997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  24.62 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  30.12 
 
 
217 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  26.79 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  26.79 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  26.79 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  33.53 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  26.92 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  25.52 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2264  YhhN family protein  25.91 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.410699  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  30.13 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  28.24 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06540  YhhN-like protein  25.13 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.677364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>