More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3433 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  100 
 
 
379 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  56.84 
 
 
378 aa  441  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1153  aminotransferase class-III  58.42 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3083  aminotransferase  53.7 
 
 
383 aa  421  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4207  aminotransferase class-III  52.79 
 
 
377 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6554  aminotransferase class-III  55.35 
 
 
376 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  37.98 
 
 
395 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.82 
 
 
395 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
394 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.95 
 
 
386 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  38.7 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  35.75 
 
 
395 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.14 
 
 
395 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  39.27 
 
 
386 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
386 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  37.16 
 
 
392 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.27 
 
 
393 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.87 
 
 
396 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.53 
 
 
385 aa  235  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  36.13 
 
 
386 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  38.74 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  34.61 
 
 
400 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4239  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
386 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.53 
 
 
396 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0997  acetylornithine aminotransferase  39.47 
 
 
386 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4037  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
386 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4352  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
386 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.200619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
386 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  37.03 
 
 
410 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  35.92 
 
 
379 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  39.01 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.96 
 
 
398 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3876  acetylornithine aminotransferase  38.48 
 
 
386 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.73 
 
 
410 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  35.73 
 
 
403 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  34.26 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  35.71 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  34.54 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.71 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.42 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  35.2 
 
 
385 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  33.84 
 
 
395 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  36.2 
 
 
402 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  37.2 
 
 
408 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1089  acetylornithine aminotransferase  38.02 
 
 
375 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  35.73 
 
 
394 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.42 
 
 
356 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  33.85 
 
 
398 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  34.27 
 
 
403 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.2 
 
 
401 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  35.7 
 
 
404 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.69 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.25 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  33.76 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  34.38 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  34.78 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.69 
 
 
375 aa  212  9e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.98 
 
 
375 aa  212  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.06 
 
 
405 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  32.99 
 
 
389 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  32.99 
 
 
389 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  34.63 
 
 
374 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  34.27 
 
 
399 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  35.58 
 
 
393 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.62 
 
 
396 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  32.87 
 
 
376 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  35.55 
 
 
390 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  33.76 
 
 
404 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.76 
 
 
403 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  33.59 
 
 
400 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  33.76 
 
 
402 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.57 
 
 
390 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  36.49 
 
 
400 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  35.2 
 
 
399 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  34.02 
 
 
391 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  34.38 
 
 
415 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.59 
 
 
399 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  34.01 
 
 
403 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.08 
 
 
408 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  34.29 
 
 
399 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  36.31 
 
 
419 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.19 
 
 
399 aa  206  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.94 
 
 
408 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  33.85 
 
 
396 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  32.47 
 
 
394 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1758  aminotransferase class-III  33.15 
 
 
384 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.84 
 
 
393 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.9 
 
 
394 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  32.74 
 
 
391 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  33.08 
 
 
405 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  33.08 
 
 
392 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.28 
 
 
405 aa  203  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.28 
 
 
405 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  34.18 
 
 
397 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  32.91 
 
 
406 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  34.7 
 
 
401 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.28 
 
 
405 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  33.59 
 
 
426 aa  202  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>