57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2571 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2571  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.255582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0632  XRE family transcriptional regulator  70.99 
 
 		 131 aa  186  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1155  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 127 aa  183  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0465  XRE family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2157  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  64.49 
 
 		 136 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0686  XRE family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 137 aa  170  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0453336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4739  XRE family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2335  XRE family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3648  XRE family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4874  XRE family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0264852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3677  XRE family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.356584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2048  XRE family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0967  helix-turn-helix domain protein  45 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131013  decreased coverage  0.000141679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2854  hypothetical protein  44.8 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4478  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1125  hypothetical protein  39.1 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3145  hypothetical protein  38.46 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4221  hypothetical protein  39.86 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0927  hypothetical protein  38.13 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121235  normal  0.0771461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0817  hypothetical protein  38.24 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0308517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0054  hypothetical protein  38.17 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1876  hypothetical protein  38.06 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0656  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000102711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4999  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2816  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0813  hypothetical protein  33.98 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0228663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  45.83 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 475 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 277 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  35.48 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  35.48 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6073  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 148 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  33.65 
 
 		 211 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  28.12 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 397 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 397 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 106 aa  40  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>