More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3097 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3097  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
423 aa  874    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3101  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.4 
 
 
414 aa  336  5e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08720  predicted acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  34.66 
 
 
413 aa  223  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09320  predicted acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  33.08 
 
 
410 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0179723  normal  0.324686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4315  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.74 
 
 
453 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2695  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.51 
 
 
398 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.96055  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1850  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.08 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.263908  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3573  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.41 
 
 
389 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3947  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.03 
 
 
401 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292669  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2503  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.71 
 
 
402 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683735  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4099  acyl-CoA transferase/L-carnitine dehydratase CaiB  31.85 
 
 
411 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0342589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6680  Acyl-coenzyme A transferase  31.53 
 
 
402 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822383  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1767  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.59 
 
 
402 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4116  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.96 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3312  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.68 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3708  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.11 
 
 
421 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3688  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.07 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0756141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.56 
 
 
403 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3748  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.07 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3675  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.07 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4155  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.73 
 
 
402 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.961602  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2914  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.41 
 
 
406 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508097  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.39 
 
 
413 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0615  Formyl-CoA transferase  30.2 
 
 
411 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3999  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30 
 
 
397 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.17 
 
 
405 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5571  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.29 
 
 
415 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0901  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.94 
 
 
410 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51715  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1398  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.73 
 
 
408 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232318  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3330  formyl-CoA transferase  29.46 
 
 
411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1337  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.62 
 
 
400 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6256  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.1 
 
 
406 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.18 
 
 
426 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2229  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.91 
 
 
396 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.135907  normal  0.368689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.68 
 
 
403 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  29.23 
 
 
423 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4703  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.27 
 
 
406 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00871383  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6359  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.71 
 
 
413 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2058  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.99 
 
 
389 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2012  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.99 
 
 
389 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3650  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.48 
 
 
399 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.794582  normal  0.980563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5189  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.33 
 
 
406 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0395978  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4082  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.13 
 
 
409 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4177  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.02 
 
 
409 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.558724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5111  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.82 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658987  normal  0.523719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2717  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.75 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.21 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5748  Formyl-CoA transferase  30.1 
 
 
397 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4648  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.82 
 
 
406 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.17 
 
 
415 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4341  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.27 
 
 
407 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.563704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5721  putative Formyl-CoA transferase  27.74 
 
 
396 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5973  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.4 
 
 
392 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4713  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.02 
 
 
408 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4564  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.96 
 
 
403 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4730  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.68 
 
 
404 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1820  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.06 
 
 
393 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4320  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.61 
 
 
468 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0580  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.61 
 
 
405 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1993  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.09 
 
 
389 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.312064  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  26.86 
 
 
418 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2652  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.46 
 
 
391 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1398  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.33 
 
 
418 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0839  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.05 
 
 
402 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00466449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  28.44 
 
 
416 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  28.71 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3015  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.3 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.472695  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3874  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.34 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  28.37 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6269  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.9 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3734  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.54 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4272  Formyl-CoA transferase  36.16 
 
 
393 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  28.27 
 
 
416 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2763  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.68 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0859  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.04 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.140864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  28.54 
 
 
416 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  28.54 
 
 
416 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  28.37 
 
 
416 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2590  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.68 
 
 
402 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.85 
 
 
424 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.201554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  27.51 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.43 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2158  Formyl-CoA transferase  28.28 
 
 
382 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  26.62 
 
 
418 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.36 
 
 
416 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.35 
 
 
390 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.27 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0289  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.77 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158157  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2948  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.78 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3809  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.72 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2275  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.54 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.559073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0062  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.12 
 
 
402 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7301  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.34 
 
 
396 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530529  normal  0.357761 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  26.76 
 
 
396 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3707  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.82 
 
 
395 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3315  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  28.18 
 
 
403 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4587  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  27.54 
 
 
410 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.187372  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  28.2 
 
 
423 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  27.96 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.392607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>