More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2147 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
318 aa  624  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06690  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  77.67 
 
 
318 aa  507  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103522  normal  0.413744 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.13 
 
 
318 aa  441  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.6653  normal  0.747134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.75 
 
 
318 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.18 
 
 
318 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.77891  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08360  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  58.9 
 
 
321 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.603278  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1272  ABC transporter, permease component  54.79 
 
 
317 aa  334  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2472  inner membrane ABC transporter permease  54.21 
 
 
316 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.025169  normal  0.132878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
332 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
313 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
334 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.14 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  41.46 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
315 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
306 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
312 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
306 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
308 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
339 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.11 
 
 
315 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
319 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.28 
 
 
314 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
315 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
333 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.1 
 
 
306 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
305 aa  205  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  38.59 
 
 
316 aa  205  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
320 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.3 
 
 
321 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
315 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
335 aa  202  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  37.7 
 
 
316 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
321 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  37.82 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  36.61 
 
 
307 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.63 
 
 
306 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
335 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
311 aa  197  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.37 
 
 
314 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
306 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
306 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
306 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  36.74 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  36.74 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
324 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
364 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
314 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
316 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
306 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
307 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
306 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.34 
 
 
316 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
329 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
317 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
321 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000414077  hitchhiker  0.00173265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
347 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
316 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
306 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  36.42 
 
 
306 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  34.82 
 
 
306 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
307 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.42 
 
 
306 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
306 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.83 
 
 
306 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
312 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
317 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
318 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.14 
 
 
306 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
341 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673833  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
306 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>