More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08360  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
321 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.603278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06690  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  62.58 
 
 
318 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103522  normal  0.413744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.57 
 
 
318 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.12 
 
 
318 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.77891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 
318 aa  358  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1272  ABC transporter, permease component  54.98 
 
 
317 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.21 
 
 
318 aa  345  5e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.6653  normal  0.747134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2472  inner membrane ABC transporter permease  57.19 
 
 
316 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.025169  normal  0.132878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
306 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
306 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
333 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
313 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.71 
 
 
339 aa  202  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.86 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.51 
 
 
321 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
338 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.59 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
313 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
334 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
318 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
315 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
311 aa  193  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
335 aa  193  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
306 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 
320 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
306 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
340 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.284622  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
306 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
306 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
318 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
311 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
339 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  37.13 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.6 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  40.76 
 
 
313 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
313 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
332 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
315 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
324 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  32.82 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  34.08 
 
 
307 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
320 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
306 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
334 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  35 
 
 
316 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
315 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
306 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
306 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
306 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
307 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  33.33 
 
 
306 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
329 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
316 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  35.42 
 
 
306 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  35.42 
 
 
306 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
307 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
338 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  36.14 
 
 
316 aa  186  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.02 
 
 
306 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  37.85 
 
 
318 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  35.11 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.08 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.11 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
306 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.08 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
310 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.08 
 
 
306 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
326 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
308 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
347 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>