More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0083 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0083  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 
370 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
381 aa  256  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  49.79 
 
 
256 aa  250  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  49.14 
 
 
378 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  49.14 
 
 
378 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.76 
 
 
408 aa  245  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.76 
 
 
408 aa  245  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  49.79 
 
 
376 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.19 
 
 
375 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
376 aa  241  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  53.6 
 
 
326 aa  240  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
395 aa  239  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
378 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  49.59 
 
 
317 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
379 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
375 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  49.58 
 
 
354 aa  235  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  49.17 
 
 
312 aa  235  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
418 aa  234  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  51.69 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
389 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  51.27 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 
382 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 
308 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  48.1 
 
 
308 aa  231  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.76 
 
 
377 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.32 
 
 
315 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.32 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  51.27 
 
 
317 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.32 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.32 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.32 
 
 
315 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  48.1 
 
 
308 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.69 
 
 
335 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  48.1 
 
 
308 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 
308 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  51.27 
 
 
317 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  51.27 
 
 
317 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 
308 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  50.88 
 
 
400 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  47.9 
 
 
324 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.1 
 
 
308 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  48.1 
 
 
308 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6271  ABC transporter related  51.04 
 
 
360 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  49.58 
 
 
312 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  49.15 
 
 
312 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 
312 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  48.32 
 
 
314 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
371 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  48.1 
 
 
316 aa  225  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  49.15 
 
 
312 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 
391 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  49.36 
 
 
391 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 
391 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  46.31 
 
 
318 aa  224  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  48.31 
 
 
312 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 
382 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.34 
 
 
382 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.34 
 
 
382 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  45.34 
 
 
382 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.34 
 
 
382 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.34 
 
 
382 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
312 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  49.79 
 
 
386 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  46.03 
 
 
334 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
312 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  53.39 
 
 
326 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
288 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
270 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  48.31 
 
 
312 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  47.23 
 
 
314 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
328 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 
389 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.13 
 
 
370 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 
321 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  46.83 
 
 
392 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 
312 aa  221  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  47.19 
 
 
312 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 
312 aa  221  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 
315 aa  221  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  47.23 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.72 
 
 
384 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  46.18 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
367 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  50.2 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1406  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515015  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  46.64 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  42.28 
 
 
393 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  46.09 
 
 
367 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 
315 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
370 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
312 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 
369 aa  218  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
312 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  47.77 
 
 
254 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>