149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2397 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  92.48 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  92.7 
 
 
308 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  91.85 
 
 
299 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  90.16 
 
 
300 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  90.16 
 
 
300 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  90.16 
 
 
300 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  90.16 
 
 
300 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  91.39 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  63.41 
 
 
308 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  64.56 
 
 
309 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  64.24 
 
 
309 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  62.46 
 
 
304 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  62.15 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  62.15 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  62.15 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  65.51 
 
 
313 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  65.51 
 
 
313 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  65.51 
 
 
313 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  61.9 
 
 
296 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  61.9 
 
 
296 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  61.59 
 
 
296 aa  407  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  61.9 
 
 
296 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  61.9 
 
 
296 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  61.9 
 
 
296 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  62.54 
 
 
300 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  62.07 
 
 
321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  62.38 
 
 
317 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  62.07 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  65.62 
 
 
292 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  65.62 
 
 
292 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  65.23 
 
 
292 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  65.23 
 
 
292 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  55.87 
 
 
310 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  65.23 
 
 
292 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  65.62 
 
 
292 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  65.23 
 
 
292 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  64.84 
 
 
292 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  64.84 
 
 
292 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  61.03 
 
 
318 aa  358  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  62.17 
 
 
314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  54.02 
 
 
319 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  54.02 
 
 
319 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  54.02 
 
 
319 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  60 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  61.42 
 
 
314 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  62.35 
 
 
255 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  49.84 
 
 
313 aa  338  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  49.21 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  49.36 
 
 
318 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  49.21 
 
 
309 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  51.3 
 
 
320 aa  322  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  48.56 
 
 
311 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  48.24 
 
 
311 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  47.92 
 
 
311 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  47.28 
 
 
307 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  49.2 
 
 
300 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  48.88 
 
 
298 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  48.88 
 
 
298 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  46.96 
 
 
296 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  48.56 
 
 
300 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  48.56 
 
 
300 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  48.56 
 
 
300 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  48.56 
 
 
300 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  50.5 
 
 
310 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  48.57 
 
 
306 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  48.79 
 
 
282 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  47.7 
 
 
302 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  46.58 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  48.84 
 
 
288 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  52.61 
 
 
313 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  48.68 
 
 
218 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  46.43 
 
 
238 aa  222  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  62.22 
 
 
135 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  66.02 
 
 
103 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  30.93 
 
 
275 aa  126  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  25.71 
 
 
308 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  27.74 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  30.85 
 
 
331 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  28.34 
 
 
345 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  30.56 
 
 
323 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  45.99 
 
 
170 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  29.6 
 
 
322 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  29.24 
 
 
322 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  29.2 
 
 
318 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  28.62 
 
 
327 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  30.26 
 
 
314 aa  99.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.62 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  28.42 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2398  hypothetical protein  63.01 
 
 
61 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  27.69 
 
 
337 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  35.25 
 
 
141 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  25.18 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  27.72 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.17 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  28.36 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  27.42 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  28.98 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  26.89 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  23.6 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>