116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4924 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  98.52 
 
 
317 aa  269  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  97.78 
 
 
317 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  94.24 
 
 
321 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  55.56 
 
 
309 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  55.56 
 
 
309 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  55.56 
 
 
313 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  55.56 
 
 
313 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  55.56 
 
 
313 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  50.37 
 
 
308 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  49.63 
 
 
304 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  49.63 
 
 
304 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  49.63 
 
 
304 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  48.89 
 
 
304 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  45.19 
 
 
308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  45.99 
 
 
319 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  48.15 
 
 
300 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  46.67 
 
 
296 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  46.67 
 
 
296 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  46.67 
 
 
296 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  46.67 
 
 
296 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  46.67 
 
 
296 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  43.51 
 
 
318 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  44.44 
 
 
296 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  42.96 
 
 
300 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  42.96 
 
 
300 aa  98.6  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  42.96 
 
 
300 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  42.96 
 
 
300 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  41.22 
 
 
334 aa  97.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  42.86 
 
 
299 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  42.86 
 
 
299 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  41.79 
 
 
292 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  45.3 
 
 
282 aa  94  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  41.79 
 
 
292 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  39.26 
 
 
310 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  41.79 
 
 
292 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  35.97 
 
 
318 aa  91.7  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  41.04 
 
 
292 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  41.04 
 
 
292 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  41.04 
 
 
292 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  41.04 
 
 
292 aa  90.9  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  41.04 
 
 
292 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  40.3 
 
 
292 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  36.3 
 
 
218 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  39.26 
 
 
319 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  39.26 
 
 
319 aa  87.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  39.26 
 
 
319 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  39.26 
 
 
307 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  37.4 
 
 
314 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  37.4 
 
 
314 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  32.59 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  32.59 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  47.06 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  47.06 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  29.63 
 
 
282 aa  67.8  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  57.58 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  71.43 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  71.43 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  71.43 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  71.43 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  71.43 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  71.43 
 
 
298 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  71.43 
 
 
298 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  33.08 
 
 
309 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  27.89 
 
 
320 aa  58.2  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  28.57 
 
 
302 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  59.46 
 
 
296 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  65.71 
 
 
306 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  59.46 
 
 
313 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  38.67 
 
 
288 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  30.08 
 
 
310 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  30.08 
 
 
238 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  36.92 
 
 
296 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  28.16 
 
 
266 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  40.82 
 
 
290 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  43.14 
 
 
292 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  34.85 
 
 
313 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  39.58 
 
 
256 aa  48.1  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  34.48 
 
 
308 aa  48.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  31.18 
 
 
291 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  32.35 
 
 
314 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  35.9 
 
 
304 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  34.85 
 
 
306 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2256  hypothetical protein  32.43 
 
 
315 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000395592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  28.42 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  23.31 
 
 
275 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  30.88 
 
 
317 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  38.18 
 
 
313 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  44.7  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  30 
 
 
298 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  29.82 
 
 
317 aa  44.7  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  36.36 
 
 
314 aa  44.7  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1226  hypothetical protein  29.2 
 
 
339 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  41.18 
 
 
317 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  38.98 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>